中医肿瘤研究所，下设8个研究室/实验室，包括：A消化系统肿瘤研究室、B肾骨脑肿瘤研究室、C血液病研究室、D呼吸系统肿瘤研究室、E心血管系肿瘤统研究室、F神经系统肿瘤研究室、G泌尿系统肿瘤研究室、H淋巴系统肿瘤研究室。

1、消化道肿瘤研究室，研究消化道肿瘤治疗方法，包括口腔、食道、胃、肠、肝等。

2、肾、骨、脑系统肿瘤研究室，研究肾、骨、脑系统肿瘤治疗方法。

3、血液病研究室：如白血病、红斑狼疮、艾滋病，血液病治疗方法研究。

4、呼吸系统肿瘤研究室，呼吸系统肿瘤治疗方法研究。

5、心血管系肿瘤统研究室，心血管系统肿瘤治疗方法研究。

6、神经系统肿瘤研究室，神经系统肿瘤治疗方法研究。

7、泌尿系统肿瘤研究室，泌尿系统肿瘤治疗方法研究。

8、淋巴系统肿瘤研究室，淋巴系统肿瘤治疗方法研究。